Skip to main content

Úvod

Začíname​

MONAILabel Server predstavuje významný pokrok v oblasti analýzy medicínskych obrazov, nielenže rozširuje možnosti platformy MONAILabel, ale aj sa bezproblémovo integruje s významným softvérom pre analýzu obrazov QuPath. Táto rozšírená verzia teraz poskytuje výskumníkom a odborníkom v medicíne komplexné riešenie pre presnú a automatizovanú segmentáciu kritických štruktúr, vrátane ciev, zápalových oblastí a endokardu v dátach z WSI snímkov získaných po biopsii srdca, ofarbených H&E alebo SRel farbením. Kombináciou MONAILabel a QuPath môžu používatelia využívať moderné modely umelej inteligencie na zefektívnenie svojho pracovného postupu analýzy, urýchliť detekciu odmietnutia transplantátu srdca a získať ďalšie poznatky v oblasti digitálnej patológie.

Čo budete potrebovať​

Pre efektívne využitie MONAILabel Server budete potrebovať nasledujúce požiadavky:

  • nainštalovaný Python alebo Docker,

  • Cuda Toolkit minimálne verzie v11.2,

  • QuPath minimálnej verzie v0.4.0,

  • GPU with CUDA support (Táto požiadavka nie je podporovaná na počítačoch s operačným systémom macOS).

Minimálne požiadavky​

Minimálne požiadavky na hardware:

  • 8GB CPU RAM

  • Grafická karta podporujúca Cuda - zoznam

  • Grafická karta minimálne s 2GB pamäte

MONAILabel Server​

MONAILabel Server je projekt, ktorý vznikol na základe diplomovej práce Ivana Vykopala na Fakulte informatiky a informačných technológií (FIIT) Slovenskej technickej univerzity (STU) a bakalárskej práce Tomáša Matejova. Server má konkrétny účel - pomáhať pri identifikácii odmietnutia srdcového aloštepu. Okrem toho, tento projekt bol realizovaný v úzkej spolupráci medzi odborníkmi z Inštitútu klinickej a experimentálnej medicíny (IKEM) a študentmi a výskumníkmi z FIIT STU. Tento projekt bol implementovaný na základe existujúceho projektu od MONAI a konkrétne MONAILabel.