QuPath

Oficiálna Dokuemntácia: https://qupath.github.io/

What is QuPath

QuPath je softvér s otvoreným zdrojovým kódom pre analýzu bioobrazov.

QuPath sa často používa na aplikácie v digitálnej patológii, pretože poskytuje výkonnú sadu nástrojov na prácu s WSI snímkami - no môže byť aplikovaný aj na mnohé iné druhy snímkov.

Medzi jeho funkcie patrí:

• Výkonné nástroje pre označovanie a vizualizáciu pomocou moderného rozhrania JavaFX

• Vstavané algoritmy pre bežné úlohy, vrátane detekcie buniek a tkanív

• Interaktívne strojové učenie, pre klasifikáciu objektov a pixelov

• Kompatibilita s ďalšími populárnymi otvorenými nástrojmi, vrátane ImageJ, OpenCV, Java Topology Suite a OMERO

• Podpora pre mnoho formátov snímok cez Bio-Formats a OpenSlide, vrátane celých snímkov a multiplexovaných dát

• Možnosť prispôsobenia a hlbšieho skúmania dát pomocou skriptovacieho jazyka Groovy.